Il 104 non è mai stato facile da pilotare; la fase di atterraggio era particolarmente impegnativa e richiedeva una concentrazione massima da parte del pilota. In Germania a causa di numerosi incidenti l'F104 veniva spesso chiamato il "Fabbricatore di vedove" o "Bara Volante". In Italia invece questo aeromobile ha subito un rateo di incidenti nella norma se paragonato ad altri aeromobili.