La Germania è stata di gran lunga la maggiore utilizzatrice europea dello Starfighter, con oltre seicento esemplari tra la Luftwaffe e la Marineflieger. Al culmine della loro carriera operativa gli F104 equipaggiavano circa 20 reparti, la maggior parte dei quali dotata di F104G. Le altre versioni acquistate  sono state l’F104F biposto da addestramento con capacità operative limitate,  il TF104G da conversione operativa sempre biposto e l’RF104G da ricognizione.